재료 그룹이라면 먼저 DFT, 분자동역학, 상장/상분리 phase-field, FEM 같은 기존 시뮬레이터 주변의 코드 조각부터 대상으로 삼는 편이 좋습니다. 예를 들어 입력 파서, 경계조건 생성기, 파라미터 스윕 로직, 혹은 surrogate 서브루틴 후보를 에이전트가 고치게 하고, 시뮬레이터 출력의 물리적 지표로 랭킹하는 식으로 시도할 수 있습니다.
다음으로는 “더 좋은 답”이 아니라 “실행 가능하고 물리 제약을 덜 어기는 답”을 우선 점수화하는 것이 안전합니다. 모델 형태를 새로 발명하게 하기보다, 기존 경험적 규칙이나 휴리스틱을 코드로 재구성하고, 시뮬레이션 결과가 이를 얼마나 개선하는지 보는 파일럿이 적합합니다.